Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC12A1Q13621 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A1Q13621 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms