Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms