Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN4PQ13434 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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