Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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