Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC16Q13042 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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