Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCB1Q12824 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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