Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2orf54Q08AI8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2orf54Q08AI8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms