Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBL2Q08999 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL2Q08999 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms