Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSRP1Q08945 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSRP1Q08945 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms