Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YDR193WYDR193W 399 nt4.09□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YDR230WYDR230W 348 nt4.09□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 GPP2YER062C 753 nt4.09□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 ASI2YNL159C 870 nt4.09□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt4.09□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 YPR174CYPR174C 666 nt4.09□□□□□ -1.75
SGO1Q08490 TAF12YDR145W 1620 nt4.09□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YNR065CYNR065C 3351 nt4.09□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 TAF7YMR227C 1773 nt4.09□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SAT4YCR008W 1812 nt4.09□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SWP82YFL049W 1872 nt4.09□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 THI13YDL244W 1023 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YIL171WYIL171W 330 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YJL049WYJL049W 1353 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YJR011CYJR011C 786 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YJR037WYJR037W 384 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YKL075CYKL075C 1353 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RAD52YML032C 1416 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 OCA2YNL056W 594 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ARP5YNL059C 2268 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 FKH2YNL068C 2589 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 TOM22YNL131W 459 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 PHR1YOR386W 1698 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YRO2YBR054W 1035 nt4.08□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 MNL1YHR204W 2391 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 OSH2YDL019C 3852 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 BBC1YJL020C 3474 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 DBP3YGL078C 1572 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SUC2YIL162W 1599 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 THR4YCR053W 1545 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 NOP12YOL041C 1380 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SEC4YFL005W 648 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 LRP1YHR081W 555 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RAD14YMR201C 1116 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YNL235CYNL235C 432 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SIL1YOL031C 1266 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 MSN1YOL116W 1149 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YPR170CYPR170C 336 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 PBN1YCL052C 1251 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 BRE4YDL231C 3378 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 OPT2YPR194C 2634 nt4.07□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ATG2YNL242W 4779 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 TPA1YER049W 1935 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 CLB3YDL155W 1284 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 HOM2YDR158W 1098 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 EPT1YHR123W 1176 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 DSE2YHR143W 978 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 NNF1YJR112W 606 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 TPK3YKL166C 1197 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ATG10YLL042C 504 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 GTT2YLL060C 702 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YMR087WYMR087W 855 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YOR082CYOR082C 342 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RPA43YOR340C 981 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YCT1YLL055W 1596 nt4.06□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 PTR3YFR029W 2037 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ARP4YJL081C 1470 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SIP1YDR422C 2448 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RPS13YDR064W 456 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 PMI40YER003C 1290 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YHI9YHR029C 885 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SWS2YNL081C 432 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RHO5YNL180C 996 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ATG3YNR007C 933 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YOL150CYOL150C 312 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YOR105WYOR105W 327 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ROK1YGL171W 1695 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 EPO1YMR124W 2832 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ERG11YHR007C 1593 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 LRG1YDL240W 3054 nt4.05□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 HCM1YCR065W 1695 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 WHI3YNL197C 1986 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YCR013CYCR013C 648 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 NOP6YDL213C 678 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 ECM11YDR446W 909 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 SPO73YER046W 432 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 OAR1YKL055C 837 nt4.04□□□□□ -1.76
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SGO1Q08490 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YPL035CYPL035C 348 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 FYV5YCL058C 459 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 FAR8YMR029C 1572 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RSC3YDR303C 2658 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 RAD4YER162C 2265 nt4.04□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YBP2YGL060W 1926 nt4.03□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 PBP4YDL053C 558 nt4.03□□□□□ -1.76
SGO1Q08490 YDL187CYDL187C 330 nt4.03□□□□□ -1.76
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