Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDR1Q08345 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDR1Q08345 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms