Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms