Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KDSRQ06136 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms