Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEUP1Q05D60 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEUP1Q05D60 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms