Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
ERCC6Q03468 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6Q03468 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms