Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB1Q02818 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB1Q02818 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms