Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRCDQ00LT1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms