Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms