Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms