Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA4P83105 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA4P83105 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms