Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRX1P78414 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRX1P78414 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRX1P78414 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRX1P78414 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IRX1P78414 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRX1P78414 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
IRX1P78414 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
IRX1P78414 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms