Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC5P78333 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC5P78333 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC5P78333 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC5P78333 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC5P78333 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms