Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms