Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVFC1P60507 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1P60507 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms