Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00313P59037 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms