Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00310P59036 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms