Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABP4P57796 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABP4P57796 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABP4P57796 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CABP4P57796 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABP4P57796 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABP4P57796 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABP4P57796 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABP4P57796 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABP4P57796 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABP4P57796 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABP4P57796 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABP4P57796 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms