Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RWDD2BP57060 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms