Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLE2P56282 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLE2P56282 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLE2P56282 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLE2P56282 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLE2P56282 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLE2P56282 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLE2P56282 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms