Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC13P55735 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms