Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRPF1P55201 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms