Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFDNP55196 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFDNP55196 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFDNP55196 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFDNP55196 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFDNP55196 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFDNP55196 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFDNP55196 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFDNP55196 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AFDNP55196 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AFDNP55196 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AFDNP55196 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AFDNP55196 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFDNP55196 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFDNP55196 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms