Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMP1P54849 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EMP1P54849 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms