Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRRX1P54821 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRRX1P54821 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms