Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB3P54284 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms