Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMTNP53814 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMTNP53814 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMTNP53814 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMTNP53814 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMTNP53814 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMTNP53814 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMTNP53814 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMTNP53814 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMTNP53814 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMTNP53814 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms