Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBX1P52954 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBX1P52954 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBX1P52954 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBX1P52954 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBX1P52954 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBX1P52954 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBX1P52954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBX1P52954 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBX1P52954 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBX1P52954 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBX1P52954 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBX1P52954 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBX1P52954 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms