Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDST1P52848 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDST1P52848 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDST1P52848 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDST1P52848 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDST1P52848 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDST1P52848 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms