Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E1P51965 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms