Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1GP51170 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms