Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAMP50895 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAMP50895 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAMP50895 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCAMP50895 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BCAMP50895 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCAMP50895 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCAMP50895 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCAMP50895 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCAMP50895 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCAMP50895 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms