Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF6P49848 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF6P49848 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF6P49848 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF6P49848 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF6P49848 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms