Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP153P49790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP153P49790 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NUP153P49790 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NUP153P49790 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NUP153P49790 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NUP153P49790 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP153P49790 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP153P49790 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP153P49790 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP153P49790 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP153P49790 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP153P49790 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP153P49790 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NUP153P49790 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NUP153P49790 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
NUP153P49790 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NUP153P49790 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NUP153P49790 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP153P49790 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP153P49790 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP153P49790 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms