Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN1BP46527 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms