Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKP46108 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKP46108 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKP46108 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRKP46108 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRKP46108 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRKP46108 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRKP46108 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRKP46108 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRKP46108 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms