Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RECQLP46063 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RECQLP46063 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RECQLP46063 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RECQLP46063 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RECQLP46063 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms