Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms