Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms