Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF9P41273 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF9P41273 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms