Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THPOP40225 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THPOP40225 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
THPOP40225 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THPOP40225 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THPOP40225 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THPOP40225 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THPOP40225 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THPOP40225 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THPOP40225 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms